微生物種群鑒定測(cè)序（16S/18S/ITS）

簡(jiǎn)介

自然界中的微生物多如恒河沙數(shù)，且其中絕大多數(shù)無(wú)法在實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng)觀察。目前所知道的微生物種數(shù)已超過(guò)了十萬(wàn)種，這還是一個(gè)正在急劇擴(kuò)大著的數(shù)字。DNA測(cè)序鑒定方法已經(jīng)被證明比傳統(tǒng)的生化分型和表型分型方法更加準(zhǔn)確、快捷，不依賴菌種本身特點(diǎn)，對(duì)所有菌種均可使用。晶能憑借先進(jìn)的測(cè)序儀器和多年的微生物檢測(cè)經(jīng)驗(yàn)，為您可提供快速、高效、權(quán)威的微生物檢測(cè)服務(wù)，包括細(xì)菌16SrDNA測(cè)序、真菌18SrDNA測(cè)序、ITS測(cè)序。

16SrDNA測(cè)序——作為一種應(yīng)用于環(huán)境微生物菌落多樣性研究的靶標(biāo)基因測(cè)序技術(shù)，通過(guò)針對(duì)覆蓋16SrDNA的1個(gè)或多個(gè)連續(xù)可變性區(qū)域進(jìn)行PCR擴(kuò)增測(cè)序來(lái)鑒定樣本微生物菌落成員和分析比較多樣本微生物菌落的結(jié)構(gòu)，Illumina的Hiseq2500和MiSeq平臺(tái)可以針對(duì)16SrDNA的1個(gè)區(qū)域進(jìn)行測(cè)序,具有對(duì)樣本更高的測(cè)序深度、鑒定更多的低豐度群落成員且以較低的費(fèi)用的優(yōu)勢(shì)完成科研項(xiàng)目。

18SrDNA測(cè)序——18SrDNA是編碼真核生物核糖體小亞基rRNA（18SrRNA）的DNA序列，其高變序列區(qū)域則能體現(xiàn)物種間的差異。通過(guò)分析18SrDNA序列，在較高級(jí)別上確定樣品的歸屬。

ITS（internaltranscribedspacer）測(cè)序——真菌核糖體基因轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)（internaltranscribedspacer,ITS），又叫內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)，是位于真菌核糖體DNA（rDNA）上18S和28S基因之間的區(qū)域片段，主要包括內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)1（ITS1）、5.8SrDNA、內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)2（ITS2），其兩側(cè)分別是18SRNA基因和28SRNA基因。

ITS序列由于選擇壓力小，在自然中變異較快，在絕大多數(shù)真菌中表現(xiàn)出序列多態(tài)性，表現(xiàn)為種內(nèi)相對(duì)一致，種間差異比較明顯，非常適合真菌鑒定以及系統(tǒng)發(fā)育分析。由于ITS鑒定快速，分析準(zhǔn)確，有效彌補(bǔ)了傳統(tǒng)鑒定方法的不足，ITS的序列分析能實(shí)質(zhì)性地反映出屬間、種間以及菌株間的堿基對(duì)差異，易于分析，目前已被廣泛應(yīng)用于真菌屬內(nèi)不同種間或近似屬間的系統(tǒng)發(fā)育研究中。
流程圖

技術(shù)優(yōu)勢(shì)

1、擁有Miseq測(cè)序平臺(tái)，高質(zhì)量、高性價(jià)比的完成客戶項(xiàng)目；

2、多項(xiàng)相關(guān)項(xiàng)目的經(jīng)驗(yàn)，為客戶的項(xiàng)目提供保障。